По данным следствия, в 2010 году Фонд "Сколково" заключил с Пономаревым договор на выполнение научно-исследовательских работ, стоимость которого составляла 750 тысяч долларов США.

По этому договору предусматривалось выполнение Пономаревым работ в несколько этапов с составлением аналитических отчетов и получением рецензий международных научных организаций.

Позднее вице-президент "Сколково" Алексей Бельтюков подписал с депутатом допсоглашение, которое снижало стоимость договора до 450 тысяч и фактически отменяло систему поэтапных отчетов.

Таким образом они создали условия для хищения средств. Чтобы легализовать оплату суммы, Бельтюков изготовил два отчета, которые не представляли абсолютно никакой научной ценности.

Для того, чтобы освоить оставшиеся 300 тысяч, они заключили еще один договор, по условиям которого депутат провел курс лекций и семинаров на тему "Коммерциализация новых технологий".

В отношении депутата Госдумы Ильи Пономарева возбуждено уголовное дело по статье "Пособничество в растрате", а старшего вице-президента Фонда "Сколково" Алексея Бельтюкова - "Растрата".